Bioanalytická chemie Využití moderních separačních metod – vysokoúčinné kapalinové chromatografie a kapilární elektroforézy při kvalitativní a kvantitavní analýze biologicky aktivních nízkomolekulárních i vysokomolekulárních látek.
Environmentální biotechnologie Studium bakteriální oxidace železa a anorganických sirných látek na buněčné a enzymové úrovni ve vztahu k aktivitě acidofilních chemolitotrofních bakterií v biohydrometalurgii a životním prostředí.
Molekulární patologie Výzkum molekulární podstaty onemocnění a interakce mezi patogenem a hostitelem u rostlin. Hledání molekulární podstaty onemocnění u člověka, vliv změn na úrovni DNA na rozvoj a průběh daného onemocnění.
Imunostanovení a nanosenzory Vývoj imunochemických stanovení a biosenzorů, využití nanočástic jako značek v imunostanoveních.
Biochemie denitrifikačních bakterií Distribuce toku elektronů v rozvětveném respiračním řetězci. Transport dusičnanu do buněk. Enzymologie flavindependentních oxidoreduktas FerA a FerB. Odezva bakteriálního proteomu na změny růstových podmínek.
Glykobiochemie Strukturně-funkční studium proteinů podílejících se na výstavbě a specifickém rozpoznávání biologicky aktivních glykokonjugátů a specifických interakcí mezi patogenem a hostitelem.
Proteomika Studium molekulárních procesů vývoje solidních nádorů a metastazování na bázi proteomiky a dalších "high-throughput" technik, identifikace biomarkerů, molekulárních cílů a možností jejich terapeutické modulace pomocí metod buněčné a molekulární biologie.
Bioanalytical chemistry on the nanometer scale Developing sensitive bioanalytical techniques with the ultimate goal to detect single molecules of an analyte. Focused on research using photon-upconversion nanoparticles and single-molecule analyses in femtoliter volumes.
Biosensory Vývoj elektrochemických a piezoelektrických biosensorů, aplikace enzymových elektrod a imunosensorů v životním prostředí a klinické oblasti, studium afinitních interakcí v reálném čase pomocí biosensorů.
Molekulární fyziologie DNA testování geneticky podmíněných chorob a DNA diagnostika virových a bakteriálních chorob v humánní a veterinární medicíně.
Sekundární metabolity Vývoj metod pro stanovení nízkomolekulárních biomolekul (LC/MS-Q-TOF, LC/MS-TOF, FLD, DAD), výzkum obranné reakce rostlin, metabolismu fytoalexinů a fytoestrogenů.
