Imunostanovení a nanosenzory
Výzkumná skupina Imunostanovení a nanosenzory vyvíjí vysoce citlivá imunostanovení pro detekci a vizualizaci klinicky a environmentálně významných analytů. Využívá řadu převodníků a značek pro nalezení optimálního řešení komplexních bioanalytických problémů. Velký důraz je při tom kladen také na použití nanomateriálů, což umožňuje nejen zvýšit citlivost konvenčních stanovení, ale také vyvíjet zcela nové detekční přístupy.
doc. Mgr. Zdeněk Farka, Ph.D.
Vedoucí skupiny
Zdeněk Farka pracuje jako docent na Ústavu biochemie Přírodovědecké fakulty Masarykovy university. V roce 2017 získal doktorát ze Strukturní biochemie pod vedením Petra Skládala na CEITEC MU. Absolvoval stáže na University of Regensburg (Německo) pod vedením Hanse-Heinera Gorrise a na University of Rouen (Francie) pod vedením Nika Hildebrandta.
ResearchGate | MUNI | Publons | ORCID
O Zdeňku Farkovi
Kontaktní informace
- Kancelář – C05/317
- Telefon – +420 549 49 7674
- E-mail – farka@mail.muni.cz
Ocenění
- 2022 – Cena rektora za mimořádné výzkumné výsledky pro mladé vědce do 35 let
- 2019 – Malá bronzová medaile MU
-
2018 – Cena Jean-Marie Lehna za chemii (první místo)
- 2018 – Cena Shimadzu pro mladé chemiky a biology (druhé místo)
- 2016 – Mezioborové setkání mladých biologů, biochemiků a chemiků (sekce Biomateriály – první místo)
- 2014 – Cena rektora pro nejlepší magisterské studenty MU
Vědecká činnost
-
Počet položek v rámci WoS – 51
- H-index – 17
- Počet citací bez autocitací – 1 083
Hlavní cíle výzkumu
- Vývoj imunochemických stanovení a biosenzorů:
Detekce a imunohistochemické zobrazování diagnostických biomarkerů (rakovina prsu a prostaty, infarkt myokardu, poškození ledvin)
Detekce patogenů (Salmonella, Escherichia coli, původci moru a hniloby včelího plodu)
Detekce potravinových a environmentálních kontaminantů (mykotoxiny, pesticidy, léčiva)
- Využití nanočástic jako značek v imunostanoveních:
Luminiscenční nanočástice (foton-upkonverzní nanočástice, kvantové tečky)
Katalytické nanočástice (nanočástice Pruské modři)
Členové skupiny
Postdoc: Ekaterina Makhneva, Ph.D.
Doktorandi: Mgr. Eliška Macháčová, Mgr. Dorota Sklenárová, Mgr. Matěj Pastucha, Mgr. Radka Obořilová
Diplomanti: Bc. Pavel Špaček, Bc. Terezie Zatloukalová
Bakalářští studenti: Martin Kopecký, Martin Naňo
Metodické přístupy
- Imunostanovení (ELISA stanovení, příprava protilátek, konjugace protilátek s enzymy)
- Biosenzory (povrchová plasmonová resonance, křemenné mikrovážky, elektrochemická impedanční spektroskopie, amperometrie)
- Biokonjugace nanočástic (modifikace povrchu, vazba biomolekul, charakterizace konjugátů pomocí DLS, NTA a gelové elektroforézy)
- Imunostanovení založená na nanočásticích (v mikrotitračních destičkách, lateral-flow imunostanovení)
- Mikroskopické techniky (fluorescenční mikroskopie, mikroskopie atomárních sil, elektronová mikroskopie)
- Práce s mikroorganismy (kultivace, příprava spor, lýze bakterií pomocí enzymů a bakteriofágů)
Mezinárodní spolupráce
- Department of Biochemistry/Biotechnology, University of Turku, Finsko (prof. Tero Soukka)
- COBRA laboratory – Organic and Bioorganic Chemistry, Reactivity and Analysis, University of Rouen, Francie (prof. Niko Hildebrandt)
- Leibniz Institute for Plasma Science and Technology, Greifswald, Německo (Dr. Katja Fricke)
- Rare Earths Department, Adam Mickiewicz University in Poznań, Polsko (Dr. Tomasz Grzyb)
Nejnovější publikace
Přehled všech publikací je na stránkách MUNI.
-
Amplification-Free Attomolar Detection of Short Nucleic Acids with Upconversion Luminescence: Eliminating Nonspecific Binding by Hybridization Complex Transfer
Analytical Chemistry, rok: 2025, ročník: 97, vydání: 3, DOI
-
Piezoelectric biosensor with dissipation monitoring enables the analysis of bacterial lytic agent activity
Scientific Reports, rok: 2025, ročník: 15, vydání: January, DOI
-
Upconversion-Linked Branched DNA Hybridization Assay for the Detection of Bacteriophage M13
Advanced Optical Materials, rok: 2025, ročník: 13, vydání: 2, DOI
-
A reusable QCM biosensor with stable antifouling nano-coating for on-site reagent-free rapid detection of E. coli O157:H7 in food products
Food Control, rok: 2024, ročník: 165, vydání: November 2024, DOI
-
Comparison of single and double pulse laser-induced breakdown spectroscopy for the detection of biomolecules tagged with photon-upconversion nanoparticles
Analytica Chimica Acta, rok: 2024, ročník: 1299, vydání: April 2024, DOI