BioSCom Lab

Biomolecular Structure in Cellular Communication


We explore how biomolecular structure drives cellular communication. Our research combines cutting-edge NMR spectroscopy with molecular and cellular biology to reveal how mitochondrial DNA, RNA, and their protein partners regulate cellular signaling, metabolism, and immune responses. By studying biomolecules directly in their native cellular environment, we aim to uncover the structural principles that govern cellular adaptation in health and disease.

Research

Mitochondrial RNA Signaling

Mitochondria communicate with the rest of the cell not only through metabolites and proteins but also through RNA molecules. Increasing evidence suggests that mitochondrial RNAs can be selectively exported from mitochondria and packaged into extracellular vesicles, where they contribute to communication between cells. However, the mechanisms controlling this transport remain largely unknown. We investigate how RNA secondary structures, including G-quadruplexes and hairpins, together with RNA-binding proteins such as GRSF1, YBX1, and hnRNPA1, determine the intracellular trafficking and intercellular transfer of mitochondrial RNAs.

doc. Mgr. Zdeněk Farka, Ph.D.

Vedoucí skupiny

Zdeněk Farka pracuje jako docent na Ústavu biochemie Přírodovědecké fakulty Masarykovy university. V roce 2017 získal doktorát ze Strukturní biochemie pod vedením Petra Skládala na CEITEC MU. Absolvoval stáže na University of Regensburg (Německo) pod vedením Hanse-Heinera Gorrise a na University of Rouen (Francie) pod vedením Nika Hildebrandta.

ResearchGate | MUNI | Publons | ORCID

O Zdeňku Farkovi

Kontaktní informace

  • Kancelář – C05/317
  • Telefon – +420 549 49 7674
  • E-mail – farka@mail.muni.cz

Ocenění

  • 2022 – Cena rektora za mimořádné výzkumné výsledky pro mladé vědce do 35 let
  • 2019 – Malá bronzová medaile MU
  • 2018 – Cena Jean-Marie Lehna za chemii (první místo)
  • 2018 – Cena Shimadzu pro mladé chemiky a biology (druhé místo)
  • 2016 – Mezioborové setkání mladých biologů, biochemiků a chemiků (sekce Biomateriály – první místo)
  • 2014 – Cena rektora pro nejlepší magisterské studenty MU

Vědecká činnost

  • Počet položek v rámci WoS – 51
  • H-index – 17
  • Počet citací bez autocitací – 1 083

Hlavní cíle výzkumu

  • Vývoj imunochemických stanovení a biosenzorů:
    Detekce a imunohistochemické zobrazování diagnostických biomarkerů (rakovina prsu a prostaty, infarkt myokardu, poškození ledvin)
    Detekce patogenů (Salmonella, Escherichia coli, původci moru a hniloby včelího plodu)
    Detekce potravinových a environmentálních kontaminantů (mykotoxiny, pesticidy, léčiva)
  • Využití nanočástic jako značek v imunostanoveních:
    Luminiscenční nanočástice (foton-upkonverzní nanočástice, kvantové tečky)
    Katalytické nanočástice (nanočástice Pruské modři)

Členové skupiny

Postdoc: Ekaterina Makhneva, Ph.D.

Doktorandi: Mgr. Eliška Macháčová, Mgr. Dorota Sklenárová, Mgr. Matěj Pastucha, Mgr. Radka Obořilová

Diplomanti: Bc. Pavel Špaček, Bc. Terezie Zatloukalová

Bakalářští studenti: Martin Kopecký, Martin Naňo

 

 

Metodické přístupy

Mezinárodní spolupráce

Nejnovější publikace

Přehled všech publikací je na stránkách MUNI.

No description

You are running an old browser version. We recommend updating your browser to its latest version.

More info